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        ????人類大腦含有數(shù)百種不同類型、總數(shù)達(dá)近千億(1011)個的神經(jīng)元,神經(jīng)信號經(jīng)由神經(jīng)元間的突觸聯(lián)接(總數(shù)約1014)所形成的神經(jīng)環(huán)路進(jìn)行接受、傳遞和處理。腦功能,諸如感知覺、學(xué)習(xí)、記憶、情感、意識等,涉及大腦多個腦區(qū)、多個核團(tuán)和多種類型神經(jīng)元群體之間的協(xié)作。因此,在全腦尺度上、在細(xì)胞甚至突觸分辨率水平上解析神經(jīng)聯(lián)接的結(jié)構(gòu)和功能,是揭示腦工作原理的重要途徑。大腦是上億年演化的結(jié)晶,其結(jié)構(gòu)復(fù)雜而有序的精巧組織是動物適應(yīng)和改造自然的優(yōu)化產(chǎn)物,蘊(yùn)含著必然的合理性、先進(jìn)性和不可替代性。因此,揭示其組織規(guī)律和功能機(jī)制,不僅是理解大腦奧秘的必由之路,也將為發(fā)展類腦智能算法與系統(tǒng)、突破馮·偌依曼構(gòu)架提供策略和思路。
        ????當(dāng)前,腦科學(xué)研究處于關(guān)鍵的歷史拐點(diǎn),正從聚焦于研究局部腦區(qū)推進(jìn)到在全腦尺度上探索神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)的設(shè)計原理和神經(jīng)信息的處理機(jī)制。在基因 - 信號通路 - 神經(jīng)元形態(tài)與功能 - 神經(jīng)環(huán)路等多個層次上,脊椎動物大腦的結(jié)構(gòu)與功能具有高度的保守性,因此可以通過研究結(jié)構(gòu)上簡單的腦來剖析人類大腦的基本工作原理。斑馬魚是目前可以從全腦尺度上解讀腦工作原理的模式脊椎動物,其大腦相對小而簡單(體積約0.1立方毫米)、且又具有相當(dāng)?shù)膹?fù)雜度(共含約105個神經(jīng)元和108個突觸聯(lián)接)。目前已可實現(xiàn)從宏觀(腦區(qū)分辨率)、介觀(細(xì)胞分辨率)、亦或微觀(突觸分辨率)層面上,在全腦尺度上對斑馬魚大腦的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行全面而系統(tǒng)的解析。
        ????本實驗室運(yùn)用跨學(xué)科交叉研究手段,通過在全腦尺度上對斑馬魚大腦結(jié)構(gòu)和功能的系統(tǒng)性研究,旨在通過剖析105個神經(jīng)元如何通過108個突觸聯(lián)接來產(chǎn)生各種腦功能與動物行為,尋找普適性的大腦結(jié)構(gòu)的設(shè)計原理和神經(jīng)信息的處理機(jī)制。同時,通過對多種研究方法的具體需求,合作研發(fā)一系列多學(xué)科交叉創(chuàng)新技術(shù)(包括基因編輯、生物探針、功能成像、大數(shù)據(jù)處理等)。進(jìn)而,基于斑馬魚全腦結(jié)構(gòu)和功能的實驗研究成果,實現(xiàn)脊椎動物智慧大腦的全腦計算模擬,發(fā)展全腦計算模型、系統(tǒng)與理論。比如,斑馬魚捕食草履蟲的過程,是一個充滿智慧的過程,需要針對相對空間位置、場景等的不斷變換,連續(xù)做出合理的抉擇,從而發(fā)起恰當(dāng)?shù)倪\(yùn)動。該捕食過程無論在智能程度、能耗、系統(tǒng)簡潔度等方面,都是目前人工智能領(lǐng)域的典范AlphaZero系列無法企及的。捕食過程所涉及的神經(jīng)原理,包括神經(jīng)環(huán)路結(jié)構(gòu)設(shè)計和神經(jīng)信息處理,可應(yīng)用于研發(fā)通用智能系統(tǒng)。因此,本實驗室以斑馬魚為模型開展的神經(jīng)系統(tǒng)研究,是一個全腦尺度上、多層次、多學(xué)科的系統(tǒng)科學(xué)工程,旨在揭示大腦運(yùn)作的基本原理,并推動腦科學(xué)與類腦智能的融合和發(fā)展。即所謂“Small Brain, Big Mind”,小小斑馬魚,可以推動腦科學(xué)-智能技術(shù)新興交叉學(xué)科的發(fā)展。
        ????針對上述研究目標(biāo),我們建立了既見“森林(全腦)、又見樹木(神經(jīng)元)甚或樹葉(突觸)”的研究策略,實現(xiàn)了對全腦神經(jīng)元結(jié)構(gòu)形態(tài)和功能活動的觀測與調(diào)控,并同時記錄動物的行為。實驗室以視覺系統(tǒng)為核心,在感覺輸入到運(yùn)動輸出的各個階段,研究感覺信息處理、多感覺整合、感覺-運(yùn)動轉(zhuǎn)換和相關(guān)行為發(fā)生的神經(jīng)環(huán)路與突觸機(jī)制。其次,由于神經(jīng)調(diào)質(zhì)系統(tǒng)的活動與情緒、注意、學(xué)習(xí)與記憶等密切相關(guān),并影響感覺輸入到運(yùn)動發(fā)生過程中每個環(huán)節(jié)的神經(jīng)信息的處理。因此,我們還研究不同神經(jīng)調(diào)質(zhì)系統(tǒng)(包括多巴胺能、去甲腎上腺素能、五羥色胺能、乙酰膽堿能等)如何對感覺-運(yùn)動信息處理產(chǎn)生不同的調(diào)節(jié)作用,并不斷完善我們提出的Bi-Pathway Brain Function Hypothesis,旨在闡明動物適應(yīng)性行為發(fā)生的基本理論。進(jìn)而,繪制出斑馬魚全腦神經(jīng)元活動的神經(jīng)聯(lián)接功能圖譜、具有細(xì)胞分辨率的全腦神經(jīng)聯(lián)接結(jié)構(gòu)圖譜和具有突觸分辨率的全腦神經(jīng)聯(lián)接結(jié)構(gòu)圖譜,旨在從全腦尺度上,在細(xì)胞和突觸水平上揭示斑馬魚大腦結(jié)構(gòu)的設(shè)計原理(即105個神經(jīng)元和108個突觸如何聯(lián)接),并闡明神經(jīng)信號處理的普適規(guī)律。
        ????大腦功能正常行使依賴于神經(jīng)活動相關(guān)的腦代謝與腦血流之間精細(xì)的動態(tài)調(diào)節(jié)。神經(jīng)元、膠質(zhì)細(xì)胞和血管組成的神經(jīng)-血管功能單元,其正常發(fā)育和功能是保證大腦正常工作的基礎(chǔ)。目前,大腦血管網(wǎng)絡(luò)以及血腦屏障是如何形成的仍是一個未解之謎。本實驗室另外一個交叉研究方向是以斑馬魚為模型,運(yùn)用分子和基因操作、活體成像、腦血管三維結(jié)構(gòu)定量分析、以及神經(jīng)科學(xué)研究相關(guān)手段等,研究腦血管三維網(wǎng)絡(luò)發(fā)育和血腦屏障形成的宏觀規(guī)律與微觀機(jī)制,闡明腦血管與神經(jīng)系統(tǒng)在發(fā)育和功能上的相互作用,尤其是神經(jīng)活動對腦血管發(fā)育的調(diào)節(jié)。


        近年來的主要研究成果包括:
        1. 全腦尺度神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能研究

        1)發(fā)現(xiàn)突觸傳遞長時程增強(qiáng)存在于視網(wǎng)膜中,為視覺經(jīng)驗引起的視網(wǎng)膜神經(jīng)環(huán)路的形成提供了突觸機(jī)制(Neuron 2012a)。該工作被 Faculty of 1000推薦,和成果6合并入選2012年度中國科學(xué)十大進(jìn)展的30條候選進(jìn)展。
        2)發(fā)現(xiàn)視網(wǎng)膜自發(fā)活動波起源于雙極細(xì)胞,而非經(jīng)典認(rèn)為的無長突細(xì)胞,并闡明了其形成的突觸和分子機(jī)制(Nature Communications 2016)、以及Müller膠質(zhì)細(xì)胞的調(diào)控作用(Cell Reports 2019),為視網(wǎng)膜波起源這個視覺領(lǐng)域中長期懸而未決的問題提供了一個明確的答案。研究生獲中國生理學(xué)會張錫鈞基金會優(yōu)秀論文獎、賽諾菲優(yōu)秀青年科學(xué)家獎等。
        3)發(fā)現(xiàn)視覺中樞神經(jīng)元和小膠質(zhì)細(xì)胞間的相互作用,揭示了小膠質(zhì)細(xì)胞對神經(jīng)活動具有穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)功能(Developmental Cell 2012)。該工作被同期雜志和Faculty of 1000點(diǎn)評,被Neuron期刊在二十五周年回顧中評為領(lǐng)域近年來最具有影響力的工作(排第一位),被認(rèn)為是揭開小膠質(zhì)細(xì)胞生理功能的奠基性工作,被本領(lǐng)域近幾年幾乎所有的重要綜述引用。研究生獲吳瑞獎和中科院院長獎等。
        4)發(fā)現(xiàn)多巴胺能神經(jīng)元和抑制性神經(jīng)元組成的功能元件,控制視覺-運(yùn)動轉(zhuǎn)換和行為選擇,揭示了視覺適應(yīng)性行為產(chǎn)生的神經(jīng)環(huán)路機(jī)制(Neuron 2016),該工作以亮度論文形式發(fā)表。研究生獲吳瑞獎、中國神經(jīng)學(xué)會張香桐神經(jīng)科學(xué)優(yōu)秀研究生論文獎等。
        5)發(fā)現(xiàn)亮偏好行為的不對稱性神經(jīng)環(huán)路機(jī)制,揭示了左側(cè)韁核在其中的關(guān)鍵作用(Neuron 2017)。工作以亮點(diǎn)論文的形式發(fā)表,并配以Video Abstract重點(diǎn)推薦。研究生獲吳瑞獎、中科院院長獎、中科院優(yōu)秀博士論文獎、長三角神經(jīng)科學(xué)青年科學(xué)家獎、中國生理學(xué)會張錫鈞基金會優(yōu)秀論文獎等。
        6)闡明視覺對聽覺-運(yùn)動通路功能和行為的跨模態(tài)調(diào)節(jié)的神經(jīng)機(jī)制,發(fā)現(xiàn)丘腦多巴胺能神經(jīng)元介導(dǎo)視-聽整合的新功能(Neuron 2012b)。和成果1合并入選2012年度中國科學(xué)十大進(jìn)展的30條候選進(jìn)展。研究生獲吳瑞獎、中科院院長獎、上海市研究生優(yōu)秀成果獎等。
        7)揭示了藍(lán)斑神經(jīng)系統(tǒng)在介導(dǎo)全身麻醉中的重要作用(Cell Reports 2018)。
        2. 腦血管和血腦屏障發(fā)育及其神經(jīng)調(diào)節(jié)
        1)揭示腦血管網(wǎng)絡(luò)的宏觀發(fā)育規(guī)律及其機(jī)制,發(fā)現(xiàn)血流變化驅(qū)動血管修剪,簡化腦血管三維網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),提高腦血流效率(PLoS Biology 2012)。工作被PLoS Biology、Nature和Faculty of 1000點(diǎn)評,被國際同行認(rèn)為是近年來腦血管領(lǐng)域的一個重要突破。研究生獲歐洲斑馬魚國際大會、Kloster Seeon國際血管發(fā)育大會優(yōu)秀墻報一等獎等。
        2)揭示大腦血管網(wǎng)絡(luò)發(fā)育過程中,腦血管路徑選擇的細(xì)胞和分子機(jī)制。發(fā)現(xiàn)大腦血管內(nèi)皮頂端細(xì)胞分支上機(jī)械敏感通道Piezo1介導(dǎo)的鈣離子活動的頻率高低決定了頂端細(xì)胞分支的收縮或伸長的命運(yùn),從而決定血管生長的路徑選擇和腦血管三維網(wǎng)絡(luò)的形成模式(Neuron 2020)。該工作被同期雜志亮點(diǎn)點(diǎn)評。成果入選首屆中國神經(jīng)科學(xué)學(xué)會中國神經(jīng)科學(xué)重大進(jìn)展。研究生獲蔡司斑馬魚研究優(yōu)秀論文一等獎等。
        3)揭示神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)腦血管功能完整性的分子機(jī)制,發(fā)現(xiàn)神經(jīng)元分泌的含有miR-132的外泌體被腦血管內(nèi)皮細(xì)胞吸收后,通過調(diào)節(jié)血腦屏障相關(guān)蛋白的表達(dá),從而動態(tài)影響腦血管的功能完整性,揭示了外泌體作為腦血管完整性的神經(jīng)調(diào)節(jié)的一個新的載體(Cell Research 2017)。該工作被同期雜志亮點(diǎn)點(diǎn)評。
        4)揭示血腦屏障的重要細(xì)胞成員-周細(xì)胞入腦的調(diào)控機(jī)制,發(fā)現(xiàn)血流通過血管內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)的Piezo通道調(diào)控周細(xì)胞中的Notch信號,從而調(diào)節(jié)入腦后的周細(xì)胞增殖,促進(jìn)血腦屏障的形成(Cell Reports 2024)。
        5)揭示TRPC1在血管發(fā)育中的重要作用(Circulation Research 2010),論文被 Faculty of 1000推薦,并被當(dāng)年度Circulation Research推薦為Must Read論文。
        3. 創(chuàng)新研究技術(shù)
        ????為開展上述基礎(chǔ)研究,實驗室創(chuàng)建了多項國際領(lǐng)先的在體研究技術(shù)體系,相關(guān)方法已被國際同行廣為采用,為相關(guān)領(lǐng)域發(fā)展起到了重要的推動作用:
        1)全腦神經(jīng)活動檢測和調(diào)控技術(shù):全細(xì)胞電生理記錄(Methods in Molecular Biology 2016),清醒斑馬魚全腦所有神經(jīng)元(10萬個)活動檢測和調(diào)控技術(shù)(Biomedical Optics Express 2018),大數(shù)據(jù)流(~ 500MB/s)實時處理系統(tǒng)實現(xiàn)全腦光學(xué)接口虛擬現(xiàn)實和全腦閉環(huán)研究新范式(Nature Neuroscience 2024,專利號ZL20231 0131178.9);
        2)探針研發(fā):神經(jīng)元多巴胺釋放檢測(Journal Neuroscience 2015),紅外電壓敏感納米探針(JACS 2020,入選中國稀土2020年度十大科技新聞),紅外鉀離子敏感納米探針(Science Advances 2020),新型遺傳編碼色氨酸探針(Cell Discovery 2023);
        3)基因編輯方法:內(nèi)含子靶向的不影響內(nèi)源基因的基因敲入(Cell Research 2015,專利號201510075155.6),大片段DNA置換(JMCB 2020),雙色標(biāo)記的條件性斑馬魚基因敲除新方法(Science China Life Science 2020,專利申請?zhí)?019112959299);
        4)軟件系統(tǒng):腦血管三維網(wǎng)絡(luò)分析系統(tǒng)(PLoS Biology 2012,軟件號201210017912.0),斑馬魚房信息化管理系統(tǒng)(軟件號2021SR0236837)等。


        ????本實驗室具有高度的學(xué)科交叉特性,擁有一支多學(xué)科交叉的年輕研究團(tuán)隊;成員特長交叉互補(bǔ),擅長的技術(shù)領(lǐng)域覆蓋從遺傳、分子、細(xì)胞、電生理、在體成像、光遺傳學(xué)、行為、電鏡、信息科學(xué)、大數(shù)據(jù)分析、光學(xué)等多個學(xué)科。同時,與國內(nèi)外近十家實驗室建立長期穩(wěn)定的跨學(xué)科合作,合作范圍涵蓋探針、光學(xué)成像方法、納米材料、大數(shù)據(jù)快速采集和處理、連續(xù)電鏡成像和重構(gòu)、神經(jīng)環(huán)路結(jié)構(gòu)與功能網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)、全腦結(jié)構(gòu)和功能模擬等領(lǐng)域。畢業(yè)的博士生和出站的博士后近俞百次次獲得多種國內(nèi)外學(xué)術(shù)獎勵,包括4人獲吳瑞獎、3人代表中科院參加國際研究生論壇、11人獲國際學(xué)術(shù)會議或?qū)W習(xí)班資助、15人在國際會議上做口頭報告等;14人已在國內(nèi)、外科研機(jī)構(gòu)獲得獨(dú)立教職/PI。
        ????實驗室長期以來形成了自由探索、鼓勵創(chuàng)新的學(xué)術(shù)氛圍;重點(diǎn)攻關(guān)、團(tuán)隊協(xié)作的科研模式;大膽假設(shè)、小心求證的工作作風(fēng);尊重信任、團(tuán)結(jié)有愛的工作環(huán)境;因材施教、發(fā)揮個性的指導(dǎo)風(fēng)格;德才兼?zhèn)洹⒁缘聻橄鹊呐囵B(yǎng)宗旨;挑戰(zhàn)自我、追求卓越的奮斗目標(biāo)。

        杜久林 博士

        研究組組長;高級研究員