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          生物網(wǎng)絡(luò)在生物系統(tǒng)中無所不在,比如神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)等等。研究生物網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和功能對(duì)理解生物系統(tǒng)的整體行為有重大意義。本實(shí)驗(yàn)室通過計(jì)算生物學(xué)、生物信息學(xué)的方法研究以神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)為主的真實(shí)生物網(wǎng)絡(luò),以理解它們?cè)谏窠?jīng)系統(tǒng)中所發(fā)揮的功能。本實(shí)驗(yàn)室有以下兩個(gè)主要研究方向:

          1. 大型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析 

          神經(jīng)科學(xué)的核心問題是理解動(dòng)物行為的神經(jīng)機(jī)理,在系統(tǒng)水平上研究神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是回答該問題的有效方法。隨著腦聯(lián)結(jié)圖譜工作的展開,多尺度腦網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和活動(dòng)的海量數(shù)據(jù)不斷涌現(xiàn),亟需新的計(jì)算方法進(jìn)行分析和更深入的理論研究。目前在包括斑馬魚在內(nèi)的物種中,已可以通過大規(guī)模鈣成像的實(shí)驗(yàn)手段得到全腦尺度、單神經(jīng)元分辨率的神經(jīng)元活動(dòng)數(shù)據(jù)。本實(shí)驗(yàn)室著重開發(fā)適用于全腦網(wǎng)絡(luò)計(jì)算分析方法,對(duì)腦功能聯(lián)結(jié)圖譜進(jìn)行重構(gòu),對(duì)其網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)進(jìn)行拓?fù)浞治觯Y(jié)合腦網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)與神經(jīng)活動(dòng)數(shù)據(jù),在系統(tǒng)水平上探索神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的設(shè)計(jì)原理。本實(shí)驗(yàn)室在該研究方向上的長(zhǎng)期目標(biāo)是揭示腦網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,發(fā)展腦內(nèi)部復(fù)雜而高效的信息處理模式的理論,啟發(fā)人工智能領(lǐng)域的研究。

          2. 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析 

          生物節(jié)律是生物界中普遍存在的極為重要的生理學(xué)過程,是生物體表現(xiàn)出的最基本的行為之一。生物節(jié)律通過一系列核心節(jié)律基因構(gòu)成的負(fù)反饋回路產(chǎn)生生物體內(nèi)的二十四小時(shí)的周期,并通過基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)協(xié)調(diào)生理和行為與光照周期的同步。生物節(jié)律對(duì)調(diào)節(jié)睡眠、新陳代謝、細(xì)胞周期等眾多的重要生物過程起著核心作用。本實(shí)驗(yàn)室采用系統(tǒng)生物學(xué)的方法,針對(duì)小鼠、斑馬魚等模式生物開展生物節(jié)律基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究。本實(shí)驗(yàn)室通過節(jié)律基因表達(dá)數(shù)據(jù)和啟動(dòng)子分析,構(gòu)建生物節(jié)律調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析發(fā)現(xiàn)新的網(wǎng)絡(luò)模塊和重要成員。本實(shí)驗(yàn)室在該研究方向上的長(zhǎng)期目標(biāo)是揭示生物節(jié)律是如何在神經(jīng)系統(tǒng)中行使功能并影響周邊組織,同時(shí)建立生物節(jié)律與神經(jīng)退行性疾病之間的聯(lián)系。

        嚴(yán) 軍 博士

        研究組組長(zhǎng);高級(jí)研究員